Немного странный пресс-релиз [1,2], который гласит, что защита от тяжёлого течения после вакцинации Спутником составляет 81%. Нам не удалось найти сам препринт (правда, не сильно и старались), и пока что не совсем понятно, как был получен результат.
Дело в том, что исследование проводилось на группе людей, заболевших COVID-19, а посчитать эффективность вакцины от тяжёлого течения заболевания или летального исхода нельзя без данных об остальной популяции (вероятно, эти данные использовались, потому что средняя оценка, полученная нами, близка к заявленному 81%).
В случае, когда не используем данные о популяции, мы сталкиваемся здесь с вероятностным парадоксом, связанным с нерепрезентативной выборкой (другой пример – попытки посмотреть на количество тяжело болеющих в Израиле, парадокс Симпсона – просто оставим ссылку [3]).
В чём же здесь может крыться парадокс? Рассмотрим гипотетическую ситуацию с группами в 100.000 человек, привитых и непривитых. Допустим, у нас будет:
Непривитых 1.000 больных, 100 тяжело больных;
Привитых 100 больных, 30 тяжело больных.
Если мы будем считать относительно количества больных, то получим отрицательную эффективность:
1 - (30/100)/(100/1000) = 1 - 0.3/0.1 = 1 - 3 = -200%,
хотя на самом деле, конечно же, эффективность против тяжёлого течения составляет
1 - (30/100) = 70%
Таким образом, чтобы рассчитать эффективность вакцинации против тяжёлого течения, нам потребуется знать размер групп привитых и непривитых (либо их соотношение). Так, мы знаем, что на 7 августа (примерная дата окончания исследования) в Санкт-Петербурге полностью привито примерно 20,5% населения, а одним компонентом – 25,7% [4]. Исходя из количества в 17 тяжело заболевших привитых и 467 непривитых [2], эффективность против тяжёлого течения составила:
1 - (17/привитых)/(467/непривитых) = 1 - (17/467)(непривитых/привитых) = 1 - (17/467)((100-25,7) / 20,5) = 86,8%
Если мы будем считать на начало периода (3 июля), то полностью привитых будет 13,4%, одним компонентом – 17,5%, и эффективность составит:
1-(17/467)((100-17,5) / 13,4) = 77,6%
Средняя оценка (82,2%), таким образом, действительно близка к заявленной эффективности против тяжёлого течения в 81%.
Нам бы хотелось увидеть методику расчёта, применённую в этом исследовании для того, чтобы делать какие-то окончательные выводы, и обратить внимание на то, что нам неизвестно, какой именно вакциной были привиты эти самые 17 человек – а это, на наш взгляд, крайне важно.
1. Вакцинация защищает пациентов с COVID-19 от госпитализации и тяжелого поражения легких: независимое исследование, https://eusp.org/news/vakcinaciya-zaschischaet-pacientov-s-covid-19-ot-gospitalizacii-i-tyazhelogo-porazheniya-legkikh-rezultaty-nezavisimogo-issledovaniya
2. Эффективность "Спутника" равна 81%, выяснили ученые из Петербурга, https://www.bbc.com/russian/news-58235075
3. https://twitter.com/nat_anest/status/1428297840808374280?s=21
4. Статистика вакцинации от коронавируса, https://gogov.ru/articles/covid-v-stats
Дело в том, что исследование проводилось на группе людей, заболевших COVID-19, а посчитать эффективность вакцины от тяжёлого течения заболевания или летального исхода нельзя без данных об остальной популяции (вероятно, эти данные использовались, потому что средняя оценка, полученная нами, близка к заявленному 81%).
В случае, когда не используем данные о популяции, мы сталкиваемся здесь с вероятностным парадоксом, связанным с нерепрезентативной выборкой (другой пример – попытки посмотреть на количество тяжело болеющих в Израиле, парадокс Симпсона – просто оставим ссылку [3]).
В чём же здесь может крыться парадокс? Рассмотрим гипотетическую ситуацию с группами в 100.000 человек, привитых и непривитых. Допустим, у нас будет:
Непривитых 1.000 больных, 100 тяжело больных;
Привитых 100 больных, 30 тяжело больных.
Если мы будем считать относительно количества больных, то получим отрицательную эффективность:
1 - (30/100)/(100/1000) = 1 - 0.3/0.1 = 1 - 3 = -200%,
хотя на самом деле, конечно же, эффективность против тяжёлого течения составляет
1 - (30/100) = 70%
Таким образом, чтобы рассчитать эффективность вакцинации против тяжёлого течения, нам потребуется знать размер групп привитых и непривитых (либо их соотношение). Так, мы знаем, что на 7 августа (примерная дата окончания исследования) в Санкт-Петербурге полностью привито примерно 20,5% населения, а одним компонентом – 25,7% [4]. Исходя из количества в 17 тяжело заболевших привитых и 467 непривитых [2], эффективность против тяжёлого течения составила:
1 - (17/привитых)/(467/непривитых) = 1 - (17/467)(непривитых/привитых) = 1 - (17/467)((100-25,7) / 20,5) = 86,8%
Если мы будем считать на начало периода (3 июля), то полностью привитых будет 13,4%, одним компонентом – 17,5%, и эффективность составит:
1-(17/467)((100-17,5) / 13,4) = 77,6%
Средняя оценка (82,2%), таким образом, действительно близка к заявленной эффективности против тяжёлого течения в 81%.
Нам бы хотелось увидеть методику расчёта, применённую в этом исследовании для того, чтобы делать какие-то окончательные выводы, и обратить внимание на то, что нам неизвестно, какой именно вакциной были привиты эти самые 17 человек – а это, на наш взгляд, крайне важно.
1. Вакцинация защищает пациентов с COVID-19 от госпитализации и тяжелого поражения легких: независимое исследование, https://eusp.org/news/vakcinaciya-zaschischaet-pacientov-s-covid-19-ot-gospitalizacii-i-tyazhelogo-porazheniya-legkikh-rezultaty-nezavisimogo-issledovaniya
2. Эффективность "Спутника" равна 81%, выяснили ученые из Петербурга, https://www.bbc.com/russian/news-58235075
3. https://twitter.com/nat_anest/status/1428297840808374280?s=21
4. Статистика вакцинации от коронавируса, https://gogov.ru/articles/covid-v-stats
Очень интересный препринт [1], показывающий, что наличие Т-клеточного ответа при титре антител ниже референса (однако, значимо отличимых от шума) не особо отличается в плане протективности от отсутствия какого-либо ответа. Это предполагалось и ранее, теперь есть сильное свидетельство.
Напомним, что по результатам народного исследования иммуногенности вакцины КовиВак [2] была получена следующая оценка: в ~50% случаев сероконверсии не было вообще, а какая-либо значимая оценка титра антител наблюдалась в единичных случаях: 1-3 квартили по Abbott Architect поместились ниже 100 AU/ml, лишь 35% значений было выше референса теста, в случае Diasorin лишь 15% значений было в серой зоне либо выше. Это как раз тот случай, что рассматривается в исследовании [1].
В настоящий момент подходит к заключительной фазе исследование «Ищем защитный титр для Delta» [3], основанное как раз на оценке титра антител этими тестами. Это исследование предварительно показывает значимую корреляцию оценки титра с вероятностью заболевания, и оценки титра антител, необходимые для значимой протективности, нерадужные даже для тех вакцинированных КовиВаком, кто имеет значения выше референса.
На нынешний момент КовиВак не должен рассматриваться как вакцина в принципе; например, не рассматривается как вакцина показавшая значительно лучшие результаты CureVac CVnCoV[4].
Вероятно, следует констатировать, что из двух российских вакцин получилась только одна – Спутник (двух, потому что ЭпиВакКорона вакциной не является). В приоритете для вакцинированных КовиВаком должен быть буст векторной или мРНК-вакциной, причём чем скорее, тем лучше. А практика введения в оборот вакцин без должным образом пройденной 3 фазы КИ ведёт к печальным последствиям.
1. A prospective study of the protective effect of SARS-CoV-2-specific antibodies and T cells in Moscow residents, https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2021.08.19.21262278v1
2. Единая Вакцина. Новости вакцинации от коронавируса, https://t.me/vaccinationcovid/3181
3. Телеграм-КИ «Ищем защитный титр для Delta», https://t.me/delta_self_research
4. CureVac COVID vaccine let-down spotlights mRNA design challenges, https://www.nature.com/articles/d41586-021-01661-0
Напомним, что по результатам народного исследования иммуногенности вакцины КовиВак [2] была получена следующая оценка: в ~50% случаев сероконверсии не было вообще, а какая-либо значимая оценка титра антител наблюдалась в единичных случаях: 1-3 квартили по Abbott Architect поместились ниже 100 AU/ml, лишь 35% значений было выше референса теста, в случае Diasorin лишь 15% значений было в серой зоне либо выше. Это как раз тот случай, что рассматривается в исследовании [1].
В настоящий момент подходит к заключительной фазе исследование «Ищем защитный титр для Delta» [3], основанное как раз на оценке титра антител этими тестами. Это исследование предварительно показывает значимую корреляцию оценки титра с вероятностью заболевания, и оценки титра антител, необходимые для значимой протективности, нерадужные даже для тех вакцинированных КовиВаком, кто имеет значения выше референса.
На нынешний момент КовиВак не должен рассматриваться как вакцина в принципе; например, не рассматривается как вакцина показавшая значительно лучшие результаты CureVac CVnCoV[4].
Вероятно, следует констатировать, что из двух российских вакцин получилась только одна – Спутник (двух, потому что ЭпиВакКорона вакциной не является). В приоритете для вакцинированных КовиВаком должен быть буст векторной или мРНК-вакциной, причём чем скорее, тем лучше. А практика введения в оборот вакцин без должным образом пройденной 3 фазы КИ ведёт к печальным последствиям.
1. A prospective study of the protective effect of SARS-CoV-2-specific antibodies and T cells in Moscow residents, https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2021.08.19.21262278v1
2. Единая Вакцина. Новости вакцинации от коронавируса, https://t.me/vaccinationcovid/3181
3. Телеграм-КИ «Ищем защитный титр для Delta», https://t.me/delta_self_research
4. CureVac COVID vaccine let-down spotlights mRNA design challenges, https://www.nature.com/articles/d41586-021-01661-0
Группа независимых исследований вакцины «ЭпиВакКорона» опубликовала статистику по заболеваемости в разрезе различных вакцин [1]. Отталкиваясь от этих данных (считая, что количество привитых различными вакцинами оценено правильно), мы можем посчитать доверительные интервалы и примерную эффективность каждой вакцины.
Для расчёта доверительного интервала мы используем угловое преобразование Фишера (также можно использовать метод Уилсона, в русскоязычной литературе применяется реже) [2].
– Спутник V: 2.990.000 вакцинированных, 256 заболевших, 86 (95% CI = 75..96) заболевших на 1 миллион;
– ЭпиВакКорона: 90.000 вакцинированных, 61 заболевший, 678 (95% CI = 518..858) заболевших на 1 миллион;
– КовиВак: 20.000 вакцинированных, 4 заболевших, 200 (95% CI = 52..444) заболевших на 1 миллион;
– Невакцинированные: 4344 заболевших, 600 (95% CI = 582..618) заболевших на миллион (указанное значение в 248 дано с учётом иммунной прослойки населения, но посчитано некорректно; также мы считаем некорректным вычитать иммунную прослойку населения, так как переболевшие вакцинируются тоже; вопрос расчёта иммунной прослойки лежит за пределами нашей небольшой заметки).
Таким образом, мы можем рассчитать эффективность каждой из вакцин на основе представленных данных:
– Спутник V: 83,5..87,9%
– ЭпиВакКорона: (минус) -47,4..16,2%
– КовиВак: 23,7..91,6%
Результаты совпадают с ожиданиями: Спутник V показывает высокую эффективность, ЭпиВакКорона – полную неэффективность, для расчёта эффективности КовиВака данных недостаточно.
1. ЭпиВакКорона, Aurora-CoV новости, https://t.me/epivakoronews/2125
2. А. М. Гржибовский, Доверительные интервалы для частот и долей, http://medstatistic.ru/articles/doveritelnye-intervaly-dlya-chastot-i-doley.pdf
Для расчёта доверительного интервала мы используем угловое преобразование Фишера (также можно использовать метод Уилсона, в русскоязычной литературе применяется реже) [2].
– Спутник V: 2.990.000 вакцинированных, 256 заболевших, 86 (95% CI = 75..96) заболевших на 1 миллион;
– ЭпиВакКорона: 90.000 вакцинированных, 61 заболевший, 678 (95% CI = 518..858) заболевших на 1 миллион;
– КовиВак: 20.000 вакцинированных, 4 заболевших, 200 (95% CI = 52..444) заболевших на 1 миллион;
– Невакцинированные: 4344 заболевших, 600 (95% CI = 582..618) заболевших на миллион (указанное значение в 248 дано с учётом иммунной прослойки населения, но посчитано некорректно; также мы считаем некорректным вычитать иммунную прослойку населения, так как переболевшие вакцинируются тоже; вопрос расчёта иммунной прослойки лежит за пределами нашей небольшой заметки).
Таким образом, мы можем рассчитать эффективность каждой из вакцин на основе представленных данных:
– Спутник V: 83,5..87,9%
– ЭпиВакКорона: (минус) -47,4..16,2%
– КовиВак: 23,7..91,6%
Результаты совпадают с ожиданиями: Спутник V показывает высокую эффективность, ЭпиВакКорона – полную неэффективность, для расчёта эффективности КовиВака данных недостаточно.
1. ЭпиВакКорона, Aurora-CoV новости, https://t.me/epivakoronews/2125
2. А. М. Гржибовский, Доверительные интервалы для частот и долей, http://medstatistic.ru/articles/doveritelnye-intervaly-dlya-chastot-i-doley.pdf
Индия одобрила первую в мире вакцину на основе ДНК против COVID-19, не требующую инъекции [1], но есть несколько моментов.
Если мы откроем исследование, посвящённое I/II фазам КИ [2], то и без того небольшую группу в 126 человек разделили на 4 подгруппы (плеча исследования):
- 1 мг, обычная инъекция
- 1 мг, безыгольная инъекция (NFIS = needle-free injection system)
- 2 мг, обычная инъекция
- 2 мг, безыгольная инъекция
Для полной иммунизации требовалось 3 инъекции по схеме 0-28-56 дней, при этом 100% иммуногенность (ожидаемая для такой небольшой группы, ДНК-вакцины, трёх введений препарата и увеличенного интервала по сравнению с другими вакцинами) наблюдалась исключительно в группе 2 мг, обычная инъекция. Для 2 введений 100% иммуногенность не была достигнута ни в одном плече исследования.
Можно констатировать, что в целом исследование интересное, но данная ДНК-вакцина пока что не достигает показателей векторных или мРНК-вакцин. Сама идея ДНК-вакцин, безусловно, заслуживает пристального внимания, и мы надеемся на успех этой разработки.
Система безыгольной инъекции не оправдывает своё предназначение и, как мы считаем, не должна использоваться без существенной доработки.
Саму вакцину имеет смысл использовать в III фазе КИ исключительно в дозировке 2 мг, 3 обычных инъекции по схеме 0-28-56 дней.
1. https://t.me/covid19_docmed/309
2. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S258953702100300X
Если мы откроем исследование, посвящённое I/II фазам КИ [2], то и без того небольшую группу в 126 человек разделили на 4 подгруппы (плеча исследования):
- 1 мг, обычная инъекция
- 1 мг, безыгольная инъекция (NFIS = needle-free injection system)
- 2 мг, обычная инъекция
- 2 мг, безыгольная инъекция
Для полной иммунизации требовалось 3 инъекции по схеме 0-28-56 дней, при этом 100% иммуногенность (ожидаемая для такой небольшой группы, ДНК-вакцины, трёх введений препарата и увеличенного интервала по сравнению с другими вакцинами) наблюдалась исключительно в группе 2 мг, обычная инъекция. Для 2 введений 100% иммуногенность не была достигнута ни в одном плече исследования.
Можно констатировать, что в целом исследование интересное, но данная ДНК-вакцина пока что не достигает показателей векторных или мРНК-вакцин. Сама идея ДНК-вакцин, безусловно, заслуживает пристального внимания, и мы надеемся на успех этой разработки.
Система безыгольной инъекции не оправдывает своё предназначение и, как мы считаем, не должна использоваться без существенной доработки.
Саму вакцину имеет смысл использовать в III фазе КИ исключительно в дозировке 2 мг, 3 обычных инъекции по схеме 0-28-56 дней.
1. https://t.me/covid19_docmed/309
2. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S258953702100300X
Нас попросили прокомментировать интервью Жолобак «Это не панацея, а моделирование вирусного инфекционного процесса» [1]. Мы использовали уже имевшийся разбор статьи Жолобак в чате сомнений системы V1V2 [2] с разрешения автора.
Итак, по словам Жолобак,
– Когда человек сталкивается с обычным вирусом… Организм никогда не начнет реагировать сразу бурно и неадекватно.
Одно из проявлений бурной и неадекватной реакции иммунной системы нам хорошо знакомо – цитокиновый шторм. Он играет одну из ключевых ролей в летальности COVID-19 [3]. Другое явление, связанное как раз с бурной ранней реакцией – низкое фукозилирование IgG, по всей видимости, связанное не только с воспалением [4], но также и с тромбозами при COVID-19.
– Сначала включаются более легкие формы, а потом, если надо, запускается формирование
антител. Они формируются примерно на седьмые сутки.
Антитела в начале болезни не формируются не потому, что они не нужны, а потому, что иммунная система не умеет их производить. Сам процесс запускается очень быстро, но V(D)J-рекомбинации (процессу рекомбинации ДНК, благодаря которому у лимфоцитов появляется возможность распознавать конкретный антиген) нужно время, чтобы научиться производить антитела (иммуноглобулины M, затем идёт переключение на другие классы).
Всё это время вирус продолжает реплицироваться в организме, нанося урон организму и не обращая особого внимания на неспецифический иммунный ответ, и когда иммунный ответ появляется, может быть уже слишком поздно (а антител нужно производить очень много, потому что в организме полно антигена).
В случае вакцинации же «настройка» лимфоцитов против конкретного возбудителя производится гораздо более элегантно, схемой прайм-буст: прайм запускает ту самую V(D)J-рекомбинацию, а через три недели (или позже) повторное введение вакцины запускает немедленный ответ лимфоцитов, уже «знающих» этот конкретный антиген. Не нужно буквально затапливать организм чужеродным белком, достаточно небольших доз, но двумя разными введениями.
– И в таких условиях организм хорошо запоминает контакт с возбудителем.
Как показывают исследования, у 36% переболевших не обнаруживается в крови антител к этому заболеванию [5]. При этом у человека есть ~2% шанс не пережить контакт с возбудителем. В случае вакцинации у человека есть 100% шанс таковую пережить и только около ~2% не получить ответ на вакцину. Само предложение «переболеть для того, чтобы выработать иммунный ответ к заболеванию» не поддаётся никакому логическому объяснению.
(продолжение следует)
[1] «Это не панацея, а моделирование вирусного инфекционного процесса», https://www.nakanune.ru/articles/117607/
[2] https://t.me/sputnikv_or_not_to_be/431137
[3] Biying Hu et al, The cytokine storm and COVID-19, https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/jmv.26232
[4] Willianne Hoepel, High titers and low fucosylation of early human anti–SARS-CoV-2 IgG promote inflammation by alveolar macrophages, https://www.science.org/doi/10.1126/scitranslmed.abf8654
[5] Weimin Liu et al, Predictors of Nonseroconversion after SARS-CoV-2 Infection, https://wwwnc.cdc.gov/eid/article/27/9/21-1042_article
Итак, по словам Жолобак,
– Когда человек сталкивается с обычным вирусом… Организм никогда не начнет реагировать сразу бурно и неадекватно.
Одно из проявлений бурной и неадекватной реакции иммунной системы нам хорошо знакомо – цитокиновый шторм. Он играет одну из ключевых ролей в летальности COVID-19 [3]. Другое явление, связанное как раз с бурной ранней реакцией – низкое фукозилирование IgG, по всей видимости, связанное не только с воспалением [4], но также и с тромбозами при COVID-19.
– Сначала включаются более легкие формы, а потом, если надо, запускается формирование
антител. Они формируются примерно на седьмые сутки.
Антитела в начале болезни не формируются не потому, что они не нужны, а потому, что иммунная система не умеет их производить. Сам процесс запускается очень быстро, но V(D)J-рекомбинации (процессу рекомбинации ДНК, благодаря которому у лимфоцитов появляется возможность распознавать конкретный антиген) нужно время, чтобы научиться производить антитела (иммуноглобулины M, затем идёт переключение на другие классы).
Всё это время вирус продолжает реплицироваться в организме, нанося урон организму и не обращая особого внимания на неспецифический иммунный ответ, и когда иммунный ответ появляется, может быть уже слишком поздно (а антител нужно производить очень много, потому что в организме полно антигена).
В случае вакцинации же «настройка» лимфоцитов против конкретного возбудителя производится гораздо более элегантно, схемой прайм-буст: прайм запускает ту самую V(D)J-рекомбинацию, а через три недели (или позже) повторное введение вакцины запускает немедленный ответ лимфоцитов, уже «знающих» этот конкретный антиген. Не нужно буквально затапливать организм чужеродным белком, достаточно небольших доз, но двумя разными введениями.
– И в таких условиях организм хорошо запоминает контакт с возбудителем.
Как показывают исследования, у 36% переболевших не обнаруживается в крови антител к этому заболеванию [5]. При этом у человека есть ~2% шанс не пережить контакт с возбудителем. В случае вакцинации у человека есть 100% шанс таковую пережить и только около ~2% не получить ответ на вакцину. Само предложение «переболеть для того, чтобы выработать иммунный ответ к заболеванию» не поддаётся никакому логическому объяснению.
(продолжение следует)
[1] «Это не панацея, а моделирование вирусного инфекционного процесса», https://www.nakanune.ru/articles/117607/
[2] https://t.me/sputnikv_or_not_to_be/431137
[3] Biying Hu et al, The cytokine storm and COVID-19, https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/jmv.26232
[4] Willianne Hoepel, High titers and low fucosylation of early human anti–SARS-CoV-2 IgG promote inflammation by alveolar macrophages, https://www.science.org/doi/10.1126/scitranslmed.abf8654
[5] Weimin Liu et al, Predictors of Nonseroconversion after SARS-CoV-2 Infection, https://wwwnc.cdc.gov/eid/article/27/9/21-1042_article
Разбор интервью Жолобак, часть 2
– Против вируса иммунный ответ преимущественно клеточный.
Это утверждение не основано ни на каких исследованиях. Более того, само понятие «клеточного ответа» не должно рассматриваться вообще, потому что непонятно, о чём идёт речь. Если это цитотоксический ответ со стороны Т-киллеров, то наблюдения за пациентами с B-клеточными иммунодефицитами показывают, что без гуморального ответа пациент не может справиться с заболеванием, и ему нужна плазма реконвалесцентов [6] либо же моноклональные антитела.
Исследования также напрямую показывают то, что антитела являются хорошим коррелятом защиты [7, 8].
Ответ T-киллеров после вакцинации векторными либо мРНК-вакцинами на последовательности S-белка также будет наблюдаться. Вопрос, нужно ли включать иные белки (например, неструктурные) в вакцину, должен рассматриваться отдельно, и пока что ответа на него нет.
– Лучше, чтобы уже на слизистой был клеточный иммунный ответ, потому что антителозависимого усиления никто не отменял.
На слизистой, конечно же, ответ гуморальный, это иммуноглобулины A. Нас конкретно интересуют IgA2, которые как раз и составляют первую линию защиты нашего организма.
Насколько нам известно [9], IgA после вакцинации появляются (и наоборот, назальное применение векторных вакцин даёт буст IgG) [10].
– Организм контактирует с изменившимся возбудителем, то ему сложно сразу перестроиться на новый возбудитель. И он "втупую" продуцирует те антитела, на которые его надрессировали. Они не нейтрализуют вирус, то есть он остается опасным для организма.
Исследования показывают падение титра нейтрализации с новыми вариантами SARS-CoV-2 [11], тем не менее, нейтрализация остаётся и нет причин думать, что она может исчезнуть совсем.
– Но в данном случае это не нейтрализованный, а активный вирус. То есть мы сами способствуем попаданию вируса в клетки. Антитела не защитили, а наоборот, помогли вирусу попасть внутрь клетки.
Мы уже писали про эффект АЗУИ, что он не наблюдался в случае SARS-CoV-2 и почему ныне существующие вакцины не допускают его появления [12].
(продолжение следует)
[6] Martin Martinot et al, Remdesivir failure with SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA-polymerase mutation in a B-cell immunodeficient patient with protracted Covid-19, https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7543308/
[7] GET OUT OF ME, https://t.me/getout_ofme/30
[8] Ivan A. Molodtsov et al, A prospective study of the protective effect of SARS-CoV-2–specific antibodies and T cells in Moscow residents, https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2021.08.19.21262278v1
[9] Joana Barros-Martins et al, Immune responses against SARS-CoV-2 variants after heterologous and homologous ChAdOx1 nCoV-19/BNT162b2 vaccination, https://www.nature.com/articles/s41591-021-01449-9
[10] Alena Makarova et al, Иммунологическая эффективность вакцины Ковивак, https://t.me/vaccinationcovid/3181
[11] Vladimir Gushchin et al, Neutralizing Activity of Sera from Sputnik V-Vaccinated People against Variants of Concern (VOC: B.1.1.7, B.1.351, P.1, B.1.617.2, B.1.617.3) and Moscow Endemic SARS-CoV-2 Variants, https://www.mdpi.com/2076-393X/9/7/779
[12] Правда о прививках, Антителозависимое усиление инфекции (АЗУИ, ADE) и SARS-CoV-2, https://t.me/vaccines_truth/13
– Против вируса иммунный ответ преимущественно клеточный.
Это утверждение не основано ни на каких исследованиях. Более того, само понятие «клеточного ответа» не должно рассматриваться вообще, потому что непонятно, о чём идёт речь. Если это цитотоксический ответ со стороны Т-киллеров, то наблюдения за пациентами с B-клеточными иммунодефицитами показывают, что без гуморального ответа пациент не может справиться с заболеванием, и ему нужна плазма реконвалесцентов [6] либо же моноклональные антитела.
Исследования также напрямую показывают то, что антитела являются хорошим коррелятом защиты [7, 8].
Ответ T-киллеров после вакцинации векторными либо мРНК-вакцинами на последовательности S-белка также будет наблюдаться. Вопрос, нужно ли включать иные белки (например, неструктурные) в вакцину, должен рассматриваться отдельно, и пока что ответа на него нет.
– Лучше, чтобы уже на слизистой был клеточный иммунный ответ, потому что антителозависимого усиления никто не отменял.
На слизистой, конечно же, ответ гуморальный, это иммуноглобулины A. Нас конкретно интересуют IgA2, которые как раз и составляют первую линию защиты нашего организма.
Насколько нам известно [9], IgA после вакцинации появляются (и наоборот, назальное применение векторных вакцин даёт буст IgG) [10].
– Организм контактирует с изменившимся возбудителем, то ему сложно сразу перестроиться на новый возбудитель. И он "втупую" продуцирует те антитела, на которые его надрессировали. Они не нейтрализуют вирус, то есть он остается опасным для организма.
Исследования показывают падение титра нейтрализации с новыми вариантами SARS-CoV-2 [11], тем не менее, нейтрализация остаётся и нет причин думать, что она может исчезнуть совсем.
– Но в данном случае это не нейтрализованный, а активный вирус. То есть мы сами способствуем попаданию вируса в клетки. Антитела не защитили, а наоборот, помогли вирусу попасть внутрь клетки.
Мы уже писали про эффект АЗУИ, что он не наблюдался в случае SARS-CoV-2 и почему ныне существующие вакцины не допускают его появления [12].
(продолжение следует)
[6] Martin Martinot et al, Remdesivir failure with SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA-polymerase mutation in a B-cell immunodeficient patient with protracted Covid-19, https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7543308/
[7] GET OUT OF ME, https://t.me/getout_ofme/30
[8] Ivan A. Molodtsov et al, A prospective study of the protective effect of SARS-CoV-2–specific antibodies and T cells in Moscow residents, https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2021.08.19.21262278v1
[9] Joana Barros-Martins et al, Immune responses against SARS-CoV-2 variants after heterologous and homologous ChAdOx1 nCoV-19/BNT162b2 vaccination, https://www.nature.com/articles/s41591-021-01449-9
[10] Alena Makarova et al, Иммунологическая эффективность вакцины Ковивак, https://t.me/vaccinationcovid/3181
[11] Vladimir Gushchin et al, Neutralizing Activity of Sera from Sputnik V-Vaccinated People against Variants of Concern (VOC: B.1.1.7, B.1.351, P.1, B.1.617.2, B.1.617.3) and Moscow Endemic SARS-CoV-2 Variants, https://www.mdpi.com/2076-393X/9/7/779
[12] Правда о прививках, Антителозависимое усиление инфекции (АЗУИ, ADE) и SARS-CoV-2, https://t.me/vaccines_truth/13
Разбор интервью Жолобак, часть 3
– Когда иммунная система начинает продуцировать антитела против белков, это должно настораживать. Может запускаться аутоиммунный процесс. Была серьезная работа китайских и американских ученых о том, что спайк-белок, попадая в кровеносное русло, вызывает воспаление сосудов.
Мы полагаем, что речь идёт о работе [13], в которой говорится, что шиповидный белок сам по себе может вызывать повреждение сосудов у сирийских хомячков. Действительно, в высоких концентрациях любой белок может быть токсичным, но высокие концентрации скорее будут достигнуты при реальном заражении (и никогда при вакцинации). Даже сильнейшие яды небелковой природы не окажут сколь-либо заметного токсического действия в тех концентрациях, которые достигаются при вакцинации.
Кроме того, в этой работе абсолютно ничего не говорится об аутоиммунном процессе. Иммунная система всегда вырабатывает антитела против белков, это её функция.
А вот как раз коронавирусная инфекция может запускать аутоиммунные заболевания [14].
– Мы получаем побочные эффекты, о которых много говорят: миокардит, тромбообразование, воспаление околосердечной сумки.
Миокардиты и перикардиты действительно являются крайне редкими побочными эффектами при вакцинации двумя мРНК-вакцинами. Миокардиты возникают (в основном) у молодых мужчин, которые в принципе склонны к таким явлениям, перикардиты – у более пожилых [15, 16]. Общая рекомендация на сегодняшний день – следует воздерживаться от чрезмерной физической активности в течение 2-3 дней после вакцинации.
Тромбообразование само по себе вследствие вакцинации является, как мы уже разбирали, мифом: единственное крайне редкое явление, так или иначе связанное с тромбообразованием (VITT), наблюдалось у вакцин AstraZeneca и Janssen [17] и не наблюдается у Спутника V.
– По ее мнению, это объясняет то, почему вскоре после вакцинации люди часто заболевают и иногда даже умирают. … На фоне вакцинации ослабляется иммунный ответ против патогенов, которые есть в окружающей среде, то есть человек становится более уязвим.
В данном случае объяснять нечего: данного эффекта попросту нет, достаточно взглянуть на кривые Каплана-Майера [18 Fig 2] для групп вакцинированных и плацебо. Эти кривые очень хорошо показывают, что заболеваемость вакцинированных никогда не превышает таковую в группе плацебо: следовательно, эффект, который пытается объяснить Жолобак, попросту отсутствует.
(продолжение следует)
[13] Yuyang Lei et al, SARS-CoV-2 Spike Protein Impairs Endothelial Function via Downregulation of ACE 2, https://www.ahajournals.org/doi/10.1161/CIRCRESAHA.121.318902
[14] Si-Yu Zhou, Emerging roles of coronavirus in autoimmune diseases, https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0188440921000837
[15] Безвольные каменщики, https://t.me/kamenschiki/879
[16] George A. Diaz, Myocarditis and Pericarditis After Vaccination for COVID-19, https://jamanetwork.com/journals/jama/fullarticle/2782900
[17] Правда о прививках, https://t.me/vaccines_truth/3
[18] Denis Y. Logunov et al, Safety and efficacy of an rAd26 and rAd5 vector-based heterologous prime-boost COVID-19 vaccine: an interim analysis of a randomised controlled phase 3 trial in Russia, https://www.thelancet.com/journals/lancet/article/PIIS0140-6736(21)00234-8/fulltext
– Когда иммунная система начинает продуцировать антитела против белков, это должно настораживать. Может запускаться аутоиммунный процесс. Была серьезная работа китайских и американских ученых о том, что спайк-белок, попадая в кровеносное русло, вызывает воспаление сосудов.
Мы полагаем, что речь идёт о работе [13], в которой говорится, что шиповидный белок сам по себе может вызывать повреждение сосудов у сирийских хомячков. Действительно, в высоких концентрациях любой белок может быть токсичным, но высокие концентрации скорее будут достигнуты при реальном заражении (и никогда при вакцинации). Даже сильнейшие яды небелковой природы не окажут сколь-либо заметного токсического действия в тех концентрациях, которые достигаются при вакцинации.
Кроме того, в этой работе абсолютно ничего не говорится об аутоиммунном процессе. Иммунная система всегда вырабатывает антитела против белков, это её функция.
А вот как раз коронавирусная инфекция может запускать аутоиммунные заболевания [14].
– Мы получаем побочные эффекты, о которых много говорят: миокардит, тромбообразование, воспаление околосердечной сумки.
Миокардиты и перикардиты действительно являются крайне редкими побочными эффектами при вакцинации двумя мРНК-вакцинами. Миокардиты возникают (в основном) у молодых мужчин, которые в принципе склонны к таким явлениям, перикардиты – у более пожилых [15, 16]. Общая рекомендация на сегодняшний день – следует воздерживаться от чрезмерной физической активности в течение 2-3 дней после вакцинации.
Тромбообразование само по себе вследствие вакцинации является, как мы уже разбирали, мифом: единственное крайне редкое явление, так или иначе связанное с тромбообразованием (VITT), наблюдалось у вакцин AstraZeneca и Janssen [17] и не наблюдается у Спутника V.
– По ее мнению, это объясняет то, почему вскоре после вакцинации люди часто заболевают и иногда даже умирают. … На фоне вакцинации ослабляется иммунный ответ против патогенов, которые есть в окружающей среде, то есть человек становится более уязвим.
В данном случае объяснять нечего: данного эффекта попросту нет, достаточно взглянуть на кривые Каплана-Майера [18 Fig 2] для групп вакцинированных и плацебо. Эти кривые очень хорошо показывают, что заболеваемость вакцинированных никогда не превышает таковую в группе плацебо: следовательно, эффект, который пытается объяснить Жолобак, попросту отсутствует.
(продолжение следует)
[13] Yuyang Lei et al, SARS-CoV-2 Spike Protein Impairs Endothelial Function via Downregulation of ACE 2, https://www.ahajournals.org/doi/10.1161/CIRCRESAHA.121.318902
[14] Si-Yu Zhou, Emerging roles of coronavirus in autoimmune diseases, https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0188440921000837
[15] Безвольные каменщики, https://t.me/kamenschiki/879
[16] George A. Diaz, Myocarditis and Pericarditis After Vaccination for COVID-19, https://jamanetwork.com/journals/jama/fullarticle/2782900
[17] Правда о прививках, https://t.me/vaccines_truth/3
[18] Denis Y. Logunov et al, Safety and efficacy of an rAd26 and rAd5 vector-based heterologous prime-boost COVID-19 vaccine: an interim analysis of a randomised controlled phase 3 trial in Russia, https://www.thelancet.com/journals/lancet/article/PIIS0140-6736(21)00234-8/fulltext
Разбор интервью Жолобак, часть 4 (окончание)
– Дети почти не реагируют на коронавирус. Это связано с тем, что на поверхности их чувствительных клеток еще нет достаточного количества тех рецепторов, которые есть у взрослых. Поэтому коронавирусная инфекция для них особой опасности не представляет. С точки зрения вирусологии сложно объяснить, зачем вакцинировать детей.
Здесь нам придётся обратиться к опыту США, которые публикуют открытую статистику по детям: 558 зарегистрированных летальных исходов, 23582 госпитализаций (2,5% от общего числа), 6177946 зарегистрированных случаев заболевания (16,4% от общего числа) [19]. Вакцинация помогла бы предотвратить эти летальные исходы и случаи госпитализации (= снизила бы нагрузку на систему здравоохранения).
Особое беспокойство доставляет вероятное влияние COVID-19 на фертильность: во многом благодаря сходству с SARS-CoV [20] наиболее широко рассматриваемым аспектом на данных момент является влияние на мужскую фертильность [21], а влияние на женскую фертильность ещё только предстоит оценить [22].
Вакцинация детей также помогла бы исключить случаи передачи вируса людям других поколений, в том числе наиболее подверженных риску тяжёлых последствий и летального исхода. Вакцина не является панацеей: иммунокомпрометированный человек может получить слишком слабый ответ на вакцину, и особенно важно, чтобы все контактные персоны тоже были вакцинированы (включая детей). Действующие вакцины позволяют провести вакцинацию детей в возрасте от 5 лет, и мы надеемся, что вскоре появятся результаты исследований на детях от 1 года.
[19] Children and COVID-19: State Data Report (14.10.2021), https://www.aap.org/en/pages/2019-novel-coronavirus-covid-19-infections/children-and-covid-19-state-level-data-report/
[20] G. Corona et al, SARS-CoV-2 infection, male fertility and sperm cryopreservation: a position statement of the Italian Society of Andrology and Sexual Medicine (SIAMS) (Società Italiana di Andrologia e Medicina della Sessualità), https://link.springer.com/article/10.1007/s40618-020-01290-w
[21] Mohamman Ali Khalili et al, Male Fertility and the COVID-19 Pandemic: Systematic Review of the Literature, https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7502312/
[22] Soodeh Mahdian et al, COVID-19 Mediated by Basigin Can Affect Male and Female Fertility, https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7604703/
– Дети почти не реагируют на коронавирус. Это связано с тем, что на поверхности их чувствительных клеток еще нет достаточного количества тех рецепторов, которые есть у взрослых. Поэтому коронавирусная инфекция для них особой опасности не представляет. С точки зрения вирусологии сложно объяснить, зачем вакцинировать детей.
Здесь нам придётся обратиться к опыту США, которые публикуют открытую статистику по детям: 558 зарегистрированных летальных исходов, 23582 госпитализаций (2,5% от общего числа), 6177946 зарегистрированных случаев заболевания (16,4% от общего числа) [19]. Вакцинация помогла бы предотвратить эти летальные исходы и случаи госпитализации (= снизила бы нагрузку на систему здравоохранения).
Особое беспокойство доставляет вероятное влияние COVID-19 на фертильность: во многом благодаря сходству с SARS-CoV [20] наиболее широко рассматриваемым аспектом на данных момент является влияние на мужскую фертильность [21], а влияние на женскую фертильность ещё только предстоит оценить [22].
Вакцинация детей также помогла бы исключить случаи передачи вируса людям других поколений, в том числе наиболее подверженных риску тяжёлых последствий и летального исхода. Вакцина не является панацеей: иммунокомпрометированный человек может получить слишком слабый ответ на вакцину, и особенно важно, чтобы все контактные персоны тоже были вакцинированы (включая детей). Действующие вакцины позволяют провести вакцинацию детей в возрасте от 5 лет, и мы надеемся, что вскоре появятся результаты исследований на детях от 1 года.
[19] Children and COVID-19: State Data Report (14.10.2021), https://www.aap.org/en/pages/2019-novel-coronavirus-covid-19-infections/children-and-covid-19-state-level-data-report/
[20] G. Corona et al, SARS-CoV-2 infection, male fertility and sperm cryopreservation: a position statement of the Italian Society of Andrology and Sexual Medicine (SIAMS) (Società Italiana di Andrologia e Medicina della Sessualità), https://link.springer.com/article/10.1007/s40618-020-01290-w
[21] Mohamman Ali Khalili et al, Male Fertility and the COVID-19 Pandemic: Systematic Review of the Literature, https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7502312/
[22] Soodeh Mahdian et al, COVID-19 Mediated by Basigin Can Affect Male and Female Fertility, https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7604703/
мРНК-вакцины хуже, чем векторные?
По крайней мере, так утверждает, например, Дмитрий Кулиш [1] на основе сравнения вакцин Comirnaty, Spikevax и Janssen [2]: титр антител у привитых векторной вакциной Janssen ниже непосредственно после вакцинации, но выше через 8 месяцев.
В действительности у нас есть серьёзные основания подозревать, что ревакцинация третьей дозой мРНК-вакцин нужна уже через полгода [3]; в свою очередь, получается, что однодозовая вакцина Janssen (которая содержит меньше векторов, чем первая доза Спутника) обеспечивает гораздо более «долгоиграющий» ответ? Каким образом это возможно?
Для того, чтобы получить ответ на этот вопрос, нам нужно взглянуть внимательно на представленные графики и обнаружить, что медианный титр антител на отрезке 8 месяцев увеличивается по сравнению с пиковым для вакцины Janssen. То есть где-то на этом участке вакцинированные получили буст: это несложно увидеть, заглянув в приложение к этому исследованию [4 Fig S1]: вакцина Janssen настолько слабее по сравнению с мРНК-вакцинами, что примерно в половине случаев вакцинированные успели получить буст коронавирусной инфекцией (возможно, что бессимптомно), в то время как для каждой из мРНК-вакцин наблюдалось (судя по представленным графикам) только по 1 случаю заболевания.
Нечто подобное можно встретить в работах по дозреванию аффинности антител со временем, если они проводятся на медработниках (которые, естественно, контактируют с SARS-CoV-2). К сожалению, мы не знаем профессиональных характеристик популяции в этом сравнении, да и сама выборка является достаточно небольшой.
Мы не хотим сказать, что мРНК-вакцины намного лучше векторных и считаем, что дело в схеме прайм-буст, которая была применена для мРНК-вакцин, для Спутника, но не для однодозовой вакцины Janssen. Мы просто хотим предложить взглянуть на приложение к этой работе прежде, чем возносить оды векторным вакцинам.
[1] Единая Вакцина, https://t.me/vaccinationcovid/3686
[2] Ai-ris Y. Collier et al, Differential Kinetics of Immune Responses Elicited by Covid-19 Vaccines, https://www.nejm.org/doi/10.1056/NEJMc2115596
[3] European Medicines Agency, Comirnaty and Spikevax: EMA recommendations on extra doses and boosters Share, https://www.ema.europa.eu/en/news/comirnaty-spikevax-ema-recommendations-extra-doses-boosters
[4] Ai-ris Y. Collier et al, https://www.nejm.org/doi/suppl/10.1056/NEJMc2115596/suppl_file/nejmc2115596_appendix.pdf
По крайней мере, так утверждает, например, Дмитрий Кулиш [1] на основе сравнения вакцин Comirnaty, Spikevax и Janssen [2]: титр антител у привитых векторной вакциной Janssen ниже непосредственно после вакцинации, но выше через 8 месяцев.
В действительности у нас есть серьёзные основания подозревать, что ревакцинация третьей дозой мРНК-вакцин нужна уже через полгода [3]; в свою очередь, получается, что однодозовая вакцина Janssen (которая содержит меньше векторов, чем первая доза Спутника) обеспечивает гораздо более «долгоиграющий» ответ? Каким образом это возможно?
Для того, чтобы получить ответ на этот вопрос, нам нужно взглянуть внимательно на представленные графики и обнаружить, что медианный титр антител на отрезке 8 месяцев увеличивается по сравнению с пиковым для вакцины Janssen. То есть где-то на этом участке вакцинированные получили буст: это несложно увидеть, заглянув в приложение к этому исследованию [4 Fig S1]: вакцина Janssen настолько слабее по сравнению с мРНК-вакцинами, что примерно в половине случаев вакцинированные успели получить буст коронавирусной инфекцией (возможно, что бессимптомно), в то время как для каждой из мРНК-вакцин наблюдалось (судя по представленным графикам) только по 1 случаю заболевания.
Нечто подобное можно встретить в работах по дозреванию аффинности антител со временем, если они проводятся на медработниках (которые, естественно, контактируют с SARS-CoV-2). К сожалению, мы не знаем профессиональных характеристик популяции в этом сравнении, да и сама выборка является достаточно небольшой.
Мы не хотим сказать, что мРНК-вакцины намного лучше векторных и считаем, что дело в схеме прайм-буст, которая была применена для мРНК-вакцин, для Спутника, но не для однодозовой вакцины Janssen. Мы просто хотим предложить взглянуть на приложение к этой работе прежде, чем возносить оды векторным вакцинам.
[1] Единая Вакцина, https://t.me/vaccinationcovid/3686
[2] Ai-ris Y. Collier et al, Differential Kinetics of Immune Responses Elicited by Covid-19 Vaccines, https://www.nejm.org/doi/10.1056/NEJMc2115596
[3] European Medicines Agency, Comirnaty and Spikevax: EMA recommendations on extra doses and boosters Share, https://www.ema.europa.eu/en/news/comirnaty-spikevax-ema-recommendations-extra-doses-boosters
[4] Ai-ris Y. Collier et al, https://www.nejm.org/doi/suppl/10.1056/NEJMc2115596/suppl_file/nejmc2115596_appendix.pdf
Ревакцинация обязательна
Препринт, показывающий эффективность вакцин от COVID-19 на протяжении 9 месяцев на основании ретроспективного анализа [1].
Если коротко: Comirnaty показала снижение с 92% на 15-30 день (сравнимо со Спутник V) до 47% на 121-180 день (4-6 месяцев). С 211 дня (7 месяцев) эффективность была ниже пределов определения (23%, сравнимо с Ковиваком на 15-30 день). Эффективность против тяжёлых заболеваний же оставалось высокой на протяжении всего периода, но не для мужчин, пожилых и людей с сопутствующими заболеваниями.
Вакцина Vaxzevria/Covishield не обнаруживала эффективность начиная со 121 дня (4 месяца).
Вывод, сделанный исследователями: эффективность вакцин снижается со временем (что неудивительно), с разной скоростью в зависимости от типа вакцины и от пола/возраста вакцинированных (у мужчин и пожилых быстрее).
Хотя данные исследования, вероятно, не являются чистыми – группа непривитых мала и может состоять из преимущественно переболевших – падение эффективности вакцин со временем является бесспорным фактом, хотя, возможно, оно не столь значительно, как заявляется в исследовании.
Можем добавить, что ревакцинацию после инактивированных вакцин желательно провести не позже 4 месяцев от даты полной вакцинации, после мРНК-вакцин – 6-8 месяцев от даты полной вакцинации. Выбор интервала 6 месяцев для ревакцинации после Спутника V представляется разумным.
Вышесказанное не говорит о том, что дата следующей ревакцинации также должна быть назначена через полгода от даты первой ревакцинации; мы не знаем, насколько хорошо сохраняется иммунитет после третьей дозы вакцины. По всей видимости, этот интервал составит от 6 месяцев до 1 года (об интервале в 1 год также заявлял глава Pfizer [2]; объявление конкретных сроков, на наш взгляд, несколько преждевременно).
Добавим, что надежды на «клеточный иммунитет», что бы под этим ни подразумевалось, не оправдываются. B-клетки памяти, вероятнее всего, не успевают сработать в случае инфицирования дельта-вариантом SARS-CoV-2, а ответ T-киллеров, судя по всему, не играет решающей роли [3,4].
1. Peter Nordström et al, Effectiveness of Covid-19 Vaccination Against Risk of Symptomatic Infection, Hospitalization, and Death Up to 9 Months: A Swedish Total-Population Cohort Study, https://papers.ssrn.com/sol3/papers.cfm?abstract_id=3949410
2. The Conversation, 3 doses, then 1 each year: why Pfizer, not AstraZeneca, is the best bet for the long haul, https://theconversation.com/3-doses-then-1-each-year-why-pfizer-not-astrazeneca-is-the-best-bet-for-the-long-haul-159137
3. GET OUT OF ME, https://t.me/getout_ofme/30
4. Ivan A. Molodtsov et al, A prospective study of the protective effect of SARS-CoV-2–specific antibodies and T cells in Moscow residents, https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2021.08.19.21262278v1
Препринт, показывающий эффективность вакцин от COVID-19 на протяжении 9 месяцев на основании ретроспективного анализа [1].
Если коротко: Comirnaty показала снижение с 92% на 15-30 день (сравнимо со Спутник V) до 47% на 121-180 день (4-6 месяцев). С 211 дня (7 месяцев) эффективность была ниже пределов определения (23%, сравнимо с Ковиваком на 15-30 день). Эффективность против тяжёлых заболеваний же оставалось высокой на протяжении всего периода, но не для мужчин, пожилых и людей с сопутствующими заболеваниями.
Вакцина Vaxzevria/Covishield не обнаруживала эффективность начиная со 121 дня (4 месяца).
Вывод, сделанный исследователями: эффективность вакцин снижается со временем (что неудивительно), с разной скоростью в зависимости от типа вакцины и от пола/возраста вакцинированных (у мужчин и пожилых быстрее).
Хотя данные исследования, вероятно, не являются чистыми – группа непривитых мала и может состоять из преимущественно переболевших – падение эффективности вакцин со временем является бесспорным фактом, хотя, возможно, оно не столь значительно, как заявляется в исследовании.
Можем добавить, что ревакцинацию после инактивированных вакцин желательно провести не позже 4 месяцев от даты полной вакцинации, после мРНК-вакцин – 6-8 месяцев от даты полной вакцинации. Выбор интервала 6 месяцев для ревакцинации после Спутника V представляется разумным.
Вышесказанное не говорит о том, что дата следующей ревакцинации также должна быть назначена через полгода от даты первой ревакцинации; мы не знаем, насколько хорошо сохраняется иммунитет после третьей дозы вакцины. По всей видимости, этот интервал составит от 6 месяцев до 1 года (об интервале в 1 год также заявлял глава Pfizer [2]; объявление конкретных сроков, на наш взгляд, несколько преждевременно).
Добавим, что надежды на «клеточный иммунитет», что бы под этим ни подразумевалось, не оправдываются. B-клетки памяти, вероятнее всего, не успевают сработать в случае инфицирования дельта-вариантом SARS-CoV-2, а ответ T-киллеров, судя по всему, не играет решающей роли [3,4].
1. Peter Nordström et al, Effectiveness of Covid-19 Vaccination Against Risk of Symptomatic Infection, Hospitalization, and Death Up to 9 Months: A Swedish Total-Population Cohort Study, https://papers.ssrn.com/sol3/papers.cfm?abstract_id=3949410
2. The Conversation, 3 doses, then 1 each year: why Pfizer, not AstraZeneca, is the best bet for the long haul, https://theconversation.com/3-doses-then-1-each-year-why-pfizer-not-astrazeneca-is-the-best-bet-for-the-long-haul-159137
3. GET OUT OF ME, https://t.me/getout_ofme/30
4. Ivan A. Molodtsov et al, A prospective study of the protective effect of SARS-CoV-2–specific antibodies and T cells in Moscow residents, https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2021.08.19.21262278v1
Поскольку к нашей небольшой заметке «мРНК-вакцины хуже, чем векторные?» [1] возникли вопросы, нам бы хотелось проиллюстрировать увиденные нами данные.
Речь идёт о вопросе «Как вообще можно заподозрить буст там, где уровень bau вроде бы достаточно равномерно снижается?» [2]. Здесь мы настоятельно рекомендуем смотреть на диаграммы не в рассматриваемой статье [3], а в приложении к ней [4 Fig S1] – в представленной диаграмме чётко виден рост титра антител. Мы добавили симулированные данные для сравнения.
[1] Правда о прививках, мРНК-вакцины хуже, чем векторные?, https://t.me/vaccines_truth/29
[2] Врачи и учёные против COVID-19, https://t.me/doctors_scientists_against_covid/150487
[3] Ai-ris Y. Collier et al, Differential Kinetics of Immune Responses Elicited by Covid-19 Vaccines, https://www.nejm.org/doi/10.1056/NEJMc2115596
[4] Ai-ris Y. Collier et al, https://www.nejm.org/doi/suppl/10.1056/NEJMc2115596/suppl_file/nejmc2115596_appendix.pdf
Речь идёт о вопросе «Как вообще можно заподозрить буст там, где уровень bau вроде бы достаточно равномерно снижается?» [2]. Здесь мы настоятельно рекомендуем смотреть на диаграммы не в рассматриваемой статье [3], а в приложении к ней [4 Fig S1] – в представленной диаграмме чётко виден рост титра антител. Мы добавили симулированные данные для сравнения.
[1] Правда о прививках, мРНК-вакцины хуже, чем векторные?, https://t.me/vaccines_truth/29
[2] Врачи и учёные против COVID-19, https://t.me/doctors_scientists_against_covid/150487
[3] Ai-ris Y. Collier et al, Differential Kinetics of Immune Responses Elicited by Covid-19 Vaccines, https://www.nejm.org/doi/10.1056/NEJMc2115596
[4] Ai-ris Y. Collier et al, https://www.nejm.org/doi/suppl/10.1056/NEJMc2115596/suppl_file/nejmc2115596_appendix.pdf
Возможен ли конец пандемии?
...в тот момент, когда прививки и лекарства станут доступными во всем мире, пандемия закончится. По словам представителя компании Moderna, это может случится к осени 2023 года… [1]
Мы с огромным интересом наблюдали за распространением вариантов SARS-CoV-2 вне человеческой популяции. Как известно, практически с самого начала пандемии появились надёжные свидетельства передачи вируса от человека куньим (европейская норка), дальнейшей передачи вируса между норками и обратной передачи человеку [2,3]. Тогда речь шла о вспышке коронавирусной инфекции на зверофермах.
Возможность появления параллельной ветви эволюции SARS-CoV-2 среди животных вызывает особые опасения; беспокойство связано в том числе с быстрым уходом от нейтрализации благодаря приобретённым мутациям [4]. Для минимизации рисков этого была разработана вакцина Карнивак-Ков [5,6].
К сожалению, новости из США не самые радостные: в популяциях белохвостых оленей, живущих как в неволе, так и на свободе, зарегистрирована множественная передача SARS-CoV-2 от человека к животным и дальнейшее распространение вируса от оленей к оленям в популяции [7].
Данная публикация имеет статус препринта, однако представленные данные вызывают серьёзные опасения в том, что пандемию COVID-19 вообще удастся когда-либо прекратить.
1. https://t.me/israeltoday/3880
2. N. Oreshkova et al, SARS-CoV-2 infection in farmed minks, the Netherlands, April and May 2020, https://www.eurosurveillance.org/content/10.2807/1560-7917.ES.2020.25.23.2001005
3. A. Hammer et al, SARS-CoV-2 Transmission between Mink (Neovison vison) and Humans, Denmark, https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7853580/
4. M. Hoffmann, SARS-CoV-2 mutations acquired in mink reduce antibody-mediated neutralization, https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2211124721003314
5. ФГБУ «ВНИИЗЖ», В России зарегистрирована первая в мире вакцина против новой коронавирусной инфекции COVID-19 для животных, разработанная учёными Россельхознадзора, https://www.arriah.ru/press-sluzhba/covid-19/?ELEMENT_ID=12096
6. Т. Галкина et al, Ветеринария сегодня, Создание вакцины против коронавирусной инфекции (COVID-19) плотоядных животных «Карнивак-Ков», https://veterinary.arriah.ru/jour/article/view/555/654
7. S. Kuchipudi et al, Multiple spillovers and onward transmission of SARS-Cov-2 in free-living and captive White-tailed deer (Odocoileus virginianus), https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.10.31.466677v1
...в тот момент, когда прививки и лекарства станут доступными во всем мире, пандемия закончится. По словам представителя компании Moderna, это может случится к осени 2023 года… [1]
Мы с огромным интересом наблюдали за распространением вариантов SARS-CoV-2 вне человеческой популяции. Как известно, практически с самого начала пандемии появились надёжные свидетельства передачи вируса от человека куньим (европейская норка), дальнейшей передачи вируса между норками и обратной передачи человеку [2,3]. Тогда речь шла о вспышке коронавирусной инфекции на зверофермах.
Возможность появления параллельной ветви эволюции SARS-CoV-2 среди животных вызывает особые опасения; беспокойство связано в том числе с быстрым уходом от нейтрализации благодаря приобретённым мутациям [4]. Для минимизации рисков этого была разработана вакцина Карнивак-Ков [5,6].
К сожалению, новости из США не самые радостные: в популяциях белохвостых оленей, живущих как в неволе, так и на свободе, зарегистрирована множественная передача SARS-CoV-2 от человека к животным и дальнейшее распространение вируса от оленей к оленям в популяции [7].
Данная публикация имеет статус препринта, однако представленные данные вызывают серьёзные опасения в том, что пандемию COVID-19 вообще удастся когда-либо прекратить.
1. https://t.me/israeltoday/3880
2. N. Oreshkova et al, SARS-CoV-2 infection in farmed minks, the Netherlands, April and May 2020, https://www.eurosurveillance.org/content/10.2807/1560-7917.ES.2020.25.23.2001005
3. A. Hammer et al, SARS-CoV-2 Transmission between Mink (Neovison vison) and Humans, Denmark, https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7853580/
4. M. Hoffmann, SARS-CoV-2 mutations acquired in mink reduce antibody-mediated neutralization, https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2211124721003314
5. ФГБУ «ВНИИЗЖ», В России зарегистрирована первая в мире вакцина против новой коронавирусной инфекции COVID-19 для животных, разработанная учёными Россельхознадзора, https://www.arriah.ru/press-sluzhba/covid-19/?ELEMENT_ID=12096
6. Т. Галкина et al, Ветеринария сегодня, Создание вакцины против коронавирусной инфекции (COVID-19) плотоядных животных «Карнивак-Ков», https://veterinary.arriah.ru/jour/article/view/555/654
7. S. Kuchipudi et al, Multiple spillovers and onward transmission of SARS-Cov-2 in free-living and captive White-tailed deer (Odocoileus virginianus), https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.10.31.466677v1
Forwarded from GET OUT OF ME
Просим прощения у дорогих подписчиков, но сейчас не совсем о науке. Впрочем, скоро будет интересный пост о роли генетики хозяина в патогенезе COVID-19.
Недавно вновь всплыло смешное доковидное видео, в котором у иконы антивакцинаторов Александра НАШЕ ВСЁ Редько находят гору поддельных ксив. Полицейские со смехом читают фейковые звания разоблачителя вакцин, а он с серьезным лицом говорит: "Вы считаете, я что-то подделал?".
Вы когда-нибудь интересовались темой докторской диссертации Александра Алексеевича? Согласно биографическим статьям, он защитил докторскую диссертацию на тему "Здоровье населения мегаполиса и качество окружающей среды на примере Санкт-Петербурга" в 2004 году, однако найти какие-либо следы диссертации за его авторством или его собственные исследования на эту тему не удается. Сам Редько в 2010 утверждал, что материалы его диссертации "засекретили" (?!), а в elibrary за его соавторством можно отыскать аж целых четыре статьи (это единственный Редько Александр Алексеевич в РИНЦ), чего катастрофически недостаточно для получения докторской степени в России. Более того, все 4 статьи были опубликованы уже после якобы присуждения докторской степени, которое, согласно биографии, было в 2004 году. В WoS и Scopus ничего найти не удалось.
В биографии также указано, что до 2014 года Редько был профессором кафедры экономики и менеджмента в науке и социальной сфере в СПбГЭУ, такая кафедра действительно существовала, однако был ли Редько профессором этой кафедры, проверить возможности нет. Сейчас такой кафедры в структуре университета нет. Также неизвестно, получал ли Александр Алексеевич реальное, а не воображаемое звание профессора.
В связи с этим у нас возник вопрос к вам, дорогие читатели: вы видели какие-то намеки на диссертацию Редько или свидетелей защиты этой диссертации? Да и вообще хоть какую-то информацию из внятных источников, а не из уст самого Редько и его коллег-фейкоделов. Поскольку в данный момент складывается четкое впечатление, что уважаемый дохтур ноук и проФФесор является обыкновенным мошенником.
Можно поддержать репостами, потому что вопрос и в самом деле весьма интересный.
Недавно вновь всплыло смешное доковидное видео, в котором у иконы антивакцинаторов Александра НАШЕ ВСЁ Редько находят гору поддельных ксив. Полицейские со смехом читают фейковые звания разоблачителя вакцин, а он с серьезным лицом говорит: "Вы считаете, я что-то подделал?".
Вы когда-нибудь интересовались темой докторской диссертации Александра Алексеевича? Согласно биографическим статьям, он защитил докторскую диссертацию на тему "Здоровье населения мегаполиса и качество окружающей среды на примере Санкт-Петербурга" в 2004 году, однако найти какие-либо следы диссертации за его авторством или его собственные исследования на эту тему не удается. Сам Редько в 2010 утверждал, что материалы его диссертации "засекретили" (?!), а в elibrary за его соавторством можно отыскать аж целых четыре статьи (это единственный Редько Александр Алексеевич в РИНЦ), чего катастрофически недостаточно для получения докторской степени в России. Более того, все 4 статьи были опубликованы уже после якобы присуждения докторской степени, которое, согласно биографии, было в 2004 году. В WoS и Scopus ничего найти не удалось.
В биографии также указано, что до 2014 года Редько был профессором кафедры экономики и менеджмента в науке и социальной сфере в СПбГЭУ, такая кафедра действительно существовала, однако был ли Редько профессором этой кафедры, проверить возможности нет. Сейчас такой кафедры в структуре университета нет. Также неизвестно, получал ли Александр Алексеевич реальное, а не воображаемое звание профессора.
В связи с этим у нас возник вопрос к вам, дорогие читатели: вы видели какие-то намеки на диссертацию Редько или свидетелей защиты этой диссертации? Да и вообще хоть какую-то информацию из внятных источников, а не из уст самого Редько и его коллег-фейкоделов. Поскольку в данный момент складывается четкое впечатление, что уважаемый дохтур ноук и проФФесор является обыкновенным мошенником.
Можно поддержать репостами, потому что вопрос и в самом деле весьма интересный.
Телеканал Санкт-Петербург
Сотрудники ФСБ устроили охоту на «фантики» и спецсигналы | Телеканал Санкт-Петербург
На Загородном проспекте охота на машины только с «красивыми» номерами. Сотрудники ГИБДД ищут незаконные спецсигналы и пропуска-непроверяйки.
Вакцина Livzon Mabpharm V-1
Как заявляют СМИ, среди вакцин, поданных на регистрацию в России, может быть «вакцина V-01 китайского производителя Livzon Mabpharm Inc – это препарат, фактически аналогичный „ЭпиВакКороне“ „Вектора“» [1].
Нам неизвестно, подавала ли компания Livzon такую заявку, однако, судя по всему, в этой вакцине используется химерный белок, в качестве антигена в котором служит полноценный рецептор-связывающий домен (RBD) S-белка [2].
RBD является небольшим участком белка (см. иллюстрацию [3]), поэтому идея создания химерного белка, обладающего большей иммуногенностью, выглядит весьма привлекательной; однако такую вакцину никак нельзя назвать пептидной, она относится к классу белковых субъединичных.
Об эффективности вакцины Livzon V-1 нам неизвестно ничего, однако по итогам I/II фаз КИ она удовлетворила критериям безопасности и является в достаточной мере иммуногенной (сероконверсия 97%) [2].
Такая вакцина является аналогом кубинской Abdala, а вовсе не ЭпиВакКороны.
1. Известия, Фармацевт рассказал о якобы заявленной на регистрацию в России вакцине от COVID-19, https://iz.ru/1192344/2021-07-13/farmatcevt-rasskazal-o-iakoby-zaiavlennoi-na-registratciiu-v-rossii-vaktcine-ot-covid-19
2. https://www.51ldb.com/shsldb/tj/content/81b1b453-e8ae-4fcc-8898-273cfb1da5db.html
3. https://t.me/vaccines_truth/19
Как заявляют СМИ, среди вакцин, поданных на регистрацию в России, может быть «вакцина V-01 китайского производителя Livzon Mabpharm Inc – это препарат, фактически аналогичный „ЭпиВакКороне“ „Вектора“» [1].
Нам неизвестно, подавала ли компания Livzon такую заявку, однако, судя по всему, в этой вакцине используется химерный белок, в качестве антигена в котором служит полноценный рецептор-связывающий домен (RBD) S-белка [2].
RBD является небольшим участком белка (см. иллюстрацию [3]), поэтому идея создания химерного белка, обладающего большей иммуногенностью, выглядит весьма привлекательной; однако такую вакцину никак нельзя назвать пептидной, она относится к классу белковых субъединичных.
Об эффективности вакцины Livzon V-1 нам неизвестно ничего, однако по итогам I/II фаз КИ она удовлетворила критериям безопасности и является в достаточной мере иммуногенной (сероконверсия 97%) [2].
Такая вакцина является аналогом кубинской Abdala, а вовсе не ЭпиВакКороны.
1. Известия, Фармацевт рассказал о якобы заявленной на регистрацию в России вакцине от COVID-19, https://iz.ru/1192344/2021-07-13/farmatcevt-rasskazal-o-iakoby-zaiavlennoi-na-registratciiu-v-rossii-vaktcine-ot-covid-19
2. https://www.51ldb.com/shsldb/tj/content/81b1b453-e8ae-4fcc-8898-273cfb1da5db.html
3. https://t.me/vaccines_truth/19
Защитный титр антител и BAU
Как мы уже говорили, титр антител можно посчитать в реакции нейтрализации ЦПД [1]. ИФА/ИХЛА дают примерную оценку титра антител в своих собственных единицах, и прямую зависимость между ними и титром нейтрализации установить можно только с достаточно большой погрешностью [2].
Поскольку коммерческие тест-системы широко доступны и массово используются, например, в России, многие существующие исследования – включая Телеграм-КИ проекта V1V2 [3] направлены на установление «защитного титра» антител, выраженного в международных единицах – BAU (binding antibody units, единицы связывающих антител). Поскольку разные тест-системы выдают существенно отличающиеся оценки титра антител в этих самых единицах [4], то исследования направлены в основном на тест-системы Abbott и Diasorin Liaison.
Однако мы можем услышать самые различные оценки, вплоть до 2200 BAU/мл [5], опираясь на исследование [6]. Что с этими оценками не так?
Не существует такого значения, которое бы защищало от заражения со 100% вероятностью. Мы можем сколь угодно близко приближаться к 100%, но никогда этого значения не достигнуть. Очевидно, что практическую ценность имеет такая защита, которая снизит эффективное репродуктивное число до значений меньше 1.
В случае с базовым репродуктивным числом = 8..10 (∂-вариант SARS-CoV-2) мы будем считать удовлетворительной защиту от заражения в ~90% в том случае, если она также обеспечивает высокий уровень защиты от среднетяжёлого течения (=госпитализации).
В том же самом исследовании [6], основанном на применении тест-системы ИФА Wantai, защита от заражения составила 89,3% для концентраций антител 141..1700 BAU/мл, заражения выше уровня 1700 BAU/мл зафиксированы не были.
Учитывая всё вышесказанное, такие оценки, как 2200 BAU/мл, кажутся абсолютно бессмысленными. Если бы нам потребовался ориентир для уверенной защиты по ИФА Wantai, можно было бы взять в качестве первого приближения середину интервала 141..1700 BAU/мл = 489 BAU/мл (среднее геометрическое).
Мы не можем рекомендовать проводить досрочную ревакцинацию в погоне за сверхвысокими BAU.
1. Правда о прививках, Как считают титр антител, https://t.me/vaccines_truth/17
2. MS Tang et al, Association between SARS-CoV-2 Neutralizing Antibodies and Commercial Serological Assays, https://academic.oup.com/clinchem/article/66/12/1538/5902446
3. Телеграм-КИ :: проект V1V2, https://t.me/delta_self_research
4. Правда о прививках, https://t.me/vaccines_truth/6
5. Так всё-таки делать прививку от SARS-CoV-2 или нет? Чат СОМнений, https://t.me/sputnikv_or_not_to_be/517125
6. C. Dimeglio et al, Antibody titers and protection against a SARS-CoV-2 infection, https://www.journalofinfection.com/article/S0163-4453(21)00483-7/fulltext
Как мы уже говорили, титр антител можно посчитать в реакции нейтрализации ЦПД [1]. ИФА/ИХЛА дают примерную оценку титра антител в своих собственных единицах, и прямую зависимость между ними и титром нейтрализации установить можно только с достаточно большой погрешностью [2].
Поскольку коммерческие тест-системы широко доступны и массово используются, например, в России, многие существующие исследования – включая Телеграм-КИ проекта V1V2 [3] направлены на установление «защитного титра» антител, выраженного в международных единицах – BAU (binding antibody units, единицы связывающих антител). Поскольку разные тест-системы выдают существенно отличающиеся оценки титра антител в этих самых единицах [4], то исследования направлены в основном на тест-системы Abbott и Diasorin Liaison.
Однако мы можем услышать самые различные оценки, вплоть до 2200 BAU/мл [5], опираясь на исследование [6]. Что с этими оценками не так?
Не существует такого значения, которое бы защищало от заражения со 100% вероятностью. Мы можем сколь угодно близко приближаться к 100%, но никогда этого значения не достигнуть. Очевидно, что практическую ценность имеет такая защита, которая снизит эффективное репродуктивное число до значений меньше 1.
В случае с базовым репродуктивным числом = 8..10 (∂-вариант SARS-CoV-2) мы будем считать удовлетворительной защиту от заражения в ~90% в том случае, если она также обеспечивает высокий уровень защиты от среднетяжёлого течения (=госпитализации).
В том же самом исследовании [6], основанном на применении тест-системы ИФА Wantai, защита от заражения составила 89,3% для концентраций антител 141..1700 BAU/мл, заражения выше уровня 1700 BAU/мл зафиксированы не были.
Учитывая всё вышесказанное, такие оценки, как 2200 BAU/мл, кажутся абсолютно бессмысленными. Если бы нам потребовался ориентир для уверенной защиты по ИФА Wantai, можно было бы взять в качестве первого приближения середину интервала 141..1700 BAU/мл = 489 BAU/мл (среднее геометрическое).
Мы не можем рекомендовать проводить досрочную ревакцинацию в погоне за сверхвысокими BAU.
1. Правда о прививках, Как считают титр антител, https://t.me/vaccines_truth/17
2. MS Tang et al, Association between SARS-CoV-2 Neutralizing Antibodies and Commercial Serological Assays, https://academic.oup.com/clinchem/article/66/12/1538/5902446
3. Телеграм-КИ :: проект V1V2, https://t.me/delta_self_research
4. Правда о прививках, https://t.me/vaccines_truth/6
5. Так всё-таки делать прививку от SARS-CoV-2 или нет? Чат СОМнений, https://t.me/sputnikv_or_not_to_be/517125
6. C. Dimeglio et al, Antibody titers and protection against a SARS-CoV-2 infection, https://www.journalofinfection.com/article/S0163-4453(21)00483-7/fulltext
Сингапур: все вакцинированы, но смерти продолжаются?
Сложная эпидемиологическая ситуация в Сингапуре вызвала интерес как противников, так и сторонников вакцинации. К началу сентября в Сингапуре было полностью привито примерно 82% населения; тем не менее, примерно с 4 сентября начался быстрый рост количества как новых случаев, так и летальных исходов; при этом две волны до начала вакцинации были значительно более слабыми [1]. Что же виновато в таком развитии событий?
Несложно убедиться, что за лето в Сингапуре дельта-вариант вытеснил все остальные [1]: в это же время завершалась основная фаза прививочной кампании. К сентябрю защита от заражения у людей, первыми получивших обе дозы вакцины, уже в достаточной мере ослабла, чтобы они участвовали в цепочке передач вируса от одного человека к другому – в гораздо менее значимой мере, впрочем, чем непривитые. Определённую роль в этом сыграло использование инактивированных вакцин Sinopharm BBIBP и Sinovac CoronaVac; совершенно логичной на этом фоне является рекомендация всем привитым этими вакцинами сделать ревакцинацию мРНК-вакцинами [2].
Если мы посмотрим на официальный отчёт министерства здравоохранения Сингапура [3], то увидим, что непривитые всё так же создают десяти-пятидесятикратно большую нагрузку на систему здравоохранения. Большинство тяжёлых пациентов при этом относится к возрастной группе 60+ [3,4]; при этом можно отметить, что ковидными больными занята треть всего коечного фонда интенсивной терапии, не менее половины из которых занимают непривитые (при показателях вакцинации взрослого населения 94%).
В связи с этим правительство Сингапура приняло логичное решение: рассмотреть возможность вакцинации детей 5-11 лет, уделить особое внимание ревакцинации (на нынешний момент 82% жителей старше 60 лет уже ревакцинированы) и отказать в бесплатной медицинской помощи невакцинированным пациентам с COVID-19 [5].
1. Our world in data, https://ourworldindata.org/covid-vaccinations?country=SGP
2. Sinovac-CoronaVac included in the National Vaccination Programme, https://www.gov.sg/article/sinovac-coronavac-included-in-the-national-vaccination-programme
3. Singapore Ministry of Health, Update on local COVID-19 situation, https://www.moh.gov.sg/news-highlights/details/update-on-local-covid-19-situation_18_November_2021
4. Singapore Ministry of Health, COVID-19 statistics, https://www.moh.gov.sg/covid-19/statistics
5. Singapore Ministry of Health, Calibrated Adjustment in stabilisation phase, https://www.moh.gov.sg/news-highlights/details/calibrated-adjustments-in-stabilisation-phase_8Nov2021
Сложная эпидемиологическая ситуация в Сингапуре вызвала интерес как противников, так и сторонников вакцинации. К началу сентября в Сингапуре было полностью привито примерно 82% населения; тем не менее, примерно с 4 сентября начался быстрый рост количества как новых случаев, так и летальных исходов; при этом две волны до начала вакцинации были значительно более слабыми [1]. Что же виновато в таком развитии событий?
Несложно убедиться, что за лето в Сингапуре дельта-вариант вытеснил все остальные [1]: в это же время завершалась основная фаза прививочной кампании. К сентябрю защита от заражения у людей, первыми получивших обе дозы вакцины, уже в достаточной мере ослабла, чтобы они участвовали в цепочке передач вируса от одного человека к другому – в гораздо менее значимой мере, впрочем, чем непривитые. Определённую роль в этом сыграло использование инактивированных вакцин Sinopharm BBIBP и Sinovac CoronaVac; совершенно логичной на этом фоне является рекомендация всем привитым этими вакцинами сделать ревакцинацию мРНК-вакцинами [2].
Если мы посмотрим на официальный отчёт министерства здравоохранения Сингапура [3], то увидим, что непривитые всё так же создают десяти-пятидесятикратно большую нагрузку на систему здравоохранения. Большинство тяжёлых пациентов при этом относится к возрастной группе 60+ [3,4]; при этом можно отметить, что ковидными больными занята треть всего коечного фонда интенсивной терапии, не менее половины из которых занимают непривитые (при показателях вакцинации взрослого населения 94%).
В связи с этим правительство Сингапура приняло логичное решение: рассмотреть возможность вакцинации детей 5-11 лет, уделить особое внимание ревакцинации (на нынешний момент 82% жителей старше 60 лет уже ревакцинированы) и отказать в бесплатной медицинской помощи невакцинированным пациентам с COVID-19 [5].
1. Our world in data, https://ourworldindata.org/covid-vaccinations?country=SGP
2. Sinovac-CoronaVac included in the National Vaccination Programme, https://www.gov.sg/article/sinovac-coronavac-included-in-the-national-vaccination-programme
3. Singapore Ministry of Health, Update on local COVID-19 situation, https://www.moh.gov.sg/news-highlights/details/update-on-local-covid-19-situation_18_November_2021
4. Singapore Ministry of Health, COVID-19 statistics, https://www.moh.gov.sg/covid-19/statistics
5. Singapore Ministry of Health, Calibrated Adjustment in stabilisation phase, https://www.moh.gov.sg/news-highlights/details/calibrated-adjustments-in-stabilisation-phase_8Nov2021
Ревакцинация вакцинами Спутник Лайт и Спутник V
Несмотря на то, что рекомендацию проводить ревакцинацию раз в 6 месяцев мы считаем разумной, хотелось бы обратить внимание на то, что официальная ревакцинация ранее 6 месяцев невозможна в принципе. При этом надо учитывать следующие моменты:
– насколько нам известно, защитные значения выше 50%, например, для вакцины Comirnaty существуют порядка 5 месяцев от даты V2;
– если QR-коды для вакцинированных будут выдаваться на 6 месяцев, то ревакцинация возможна только по истечении действия QR-кода и какое-то время человек неизбежно будет ограничен в своих правах;
– в отличие от первичной вакцинации, во время ревакцинации Спутником V нет необходимости спешить с вводом RV2 (RV1 уже будет бустом);
– длительность иммунитета к вектору составляет порядка 8 недель.
Исходя из вышеперечисленного, нам казалось бы разумным применять несколько иной подход к ревакцинации, в частности:
– разрешить ревакцинацию не через 6 месяцев, а через 4,5 (18 недель) – это создаст комфортный интервал для выбора времени ревакцинации и не скажется на эффективности защиты;
– более точно обозначить группы, для которых рекомендована ревакцинация Спутником V: это не только группа 60+, но и люди, применяющие иммуносупрессивные препараты и иные иммунокомпрометированные лица;
– разрешить ревакцинацию для онкобольных, получающих химио- и лучевую терапию, через 12 недель (ввиду того, что данные виды терапии крайне нежелательно сдвигать по времени);
– при наличии свидетельства того, что вакцинация либо ревакцинация не сработали, предоставить возможность ревакцинироваться спустя 12 недель от последней полученной дозы вакцины;
– изменить интервал по умолчанию между RV1 и RV2 с 3 до 6-8 недель (оставив возможность выбирать в пределах 3-12 недель).
Такие меры могли бы предотвратить значительное количество случаев заболевания COVID-19, и, кроме того, сильно упростили бы жизнь людей.
Вместе с тем хотелось бы отметить, что мы не говорим о необходимости снижения интервала между ревакцинациями; речь идёт лишь о том, чтобы позволить людям выбирать даты ревакцинации, не отменяя своих планов.
Мы также ожидаем окончания исследования двухдозовой комбинации AstraZeneca + Спутник и надеемся, что мРНК-вакцины также появятся на рынке. Гетерологичный буст, вероятно, даёт достаточно хорошие результаты и позволит избежать единичных случаев с отсутствием буста во время ревакцинации.
Несмотря на то, что рекомендацию проводить ревакцинацию раз в 6 месяцев мы считаем разумной, хотелось бы обратить внимание на то, что официальная ревакцинация ранее 6 месяцев невозможна в принципе. При этом надо учитывать следующие моменты:
– насколько нам известно, защитные значения выше 50%, например, для вакцины Comirnaty существуют порядка 5 месяцев от даты V2;
– если QR-коды для вакцинированных будут выдаваться на 6 месяцев, то ревакцинация возможна только по истечении действия QR-кода и какое-то время человек неизбежно будет ограничен в своих правах;
– в отличие от первичной вакцинации, во время ревакцинации Спутником V нет необходимости спешить с вводом RV2 (RV1 уже будет бустом);
– длительность иммунитета к вектору составляет порядка 8 недель.
Исходя из вышеперечисленного, нам казалось бы разумным применять несколько иной подход к ревакцинации, в частности:
– разрешить ревакцинацию не через 6 месяцев, а через 4,5 (18 недель) – это создаст комфортный интервал для выбора времени ревакцинации и не скажется на эффективности защиты;
– более точно обозначить группы, для которых рекомендована ревакцинация Спутником V: это не только группа 60+, но и люди, применяющие иммуносупрессивные препараты и иные иммунокомпрометированные лица;
– разрешить ревакцинацию для онкобольных, получающих химио- и лучевую терапию, через 12 недель (ввиду того, что данные виды терапии крайне нежелательно сдвигать по времени);
– при наличии свидетельства того, что вакцинация либо ревакцинация не сработали, предоставить возможность ревакцинироваться спустя 12 недель от последней полученной дозы вакцины;
– изменить интервал по умолчанию между RV1 и RV2 с 3 до 6-8 недель (оставив возможность выбирать в пределах 3-12 недель).
Такие меры могли бы предотвратить значительное количество случаев заболевания COVID-19, и, кроме того, сильно упростили бы жизнь людей.
Вместе с тем хотелось бы отметить, что мы не говорим о необходимости снижения интервала между ревакцинациями; речь идёт лишь о том, чтобы позволить людям выбирать даты ревакцинации, не отменяя своих планов.
Мы также ожидаем окончания исследования двухдозовой комбинации AstraZeneca + Спутник и надеемся, что мРНК-вакцины также появятся на рынке. Гетерологичный буст, вероятно, даёт достаточно хорошие результаты и позволит избежать единичных случаев с отсутствием буста во время ревакцинации.
Дельта и Омикрон, Альфа и Омега
С самого начала пандемии несколько регионов вызывали у нас особые опасения. В их число, безусловно, входили и Индия, и Южная Африка.
Страны Южной Африки – одни из беднейших стран мира с крайне важной особенностью: высокой долей людей, живущих с ВИЧ – кое-где доля ВИЧ-положительных подростков и взрослых 15-49 лет составляет 18,2-27,6% в ЮАР, Ботсване, Лесото и Эсватини (бывш. Свазиленд) [1]. Несмотря на успехи в тестировании и обеспечении ВААРТ ВИЧ-положительных жителей этого региона (цель 90-90-90: минимум 90% ВИЧ-положительных знают свой статус, минимум 90% их них принимают терапию, минимум 90% их них имеют неопределяемую вирусную нагрузку), в абсолютных числах количество людей, не знающих свой статус, не принимающих терапию или не достигших неопределяемой вирусной нагрузки, и с весьма высокой вероятностью иммунокомпрометированных вследствие этого, велико.
Как нам известно из множества кейсов [2,3], у таких пациентов возможна персистенция SARS-CoV-2. В случае ВИЧ-инфекции ситуация отягощена тем, что выпадает целое звено иммунитета – T-хелперы – без которого невозможно формирование полноценного иммунного ответа. За время персистенции, измеряемое месяцами, вирус успевает в достаточной мере мутировать, чтобы успеть уйти от начавших появляться антител. Именно поэтому мы увидели такую дисперсию в мутациях: Индия, благодаря высокой плотности населения, дала менее уходящий от иммунного ответа, но весьма быстро распространяющийся вариант дельта, а ЮАР дала вариант бета – менее патогенный, но хорошо уходящий от иммунного ответа. Вариант дельта оказался настолько успешным, что вытеснил все остальные варианты из поля зрения.
Появление нового варианта, сочетающего оба этих свойства, было достаточно ожидаемым. Эволюционировав – вероятнее всего – в иммунокомпрометированных, он был обнаружен среди полностью привитых в Ботсване [4]. Как сообщается, из трёх заболевших в Израиле один был привит двумя дозами Vaxzevria, один – двумя дозами Janssen, а один – 3 дозами вакцины Comirnaty [5], что особенно настораживает.
Новому варианту была присвоена буква греческого алфавита ο (омикрон). ПЦР-тесты пока что его способны распознать, но по отдельным сообщениям лабораторий один из тестов неспособен обнаружить один из трёх целевых генов [6].
Разработчики вакцин ожидают данных о том, насколько имеющиеся вакцины эффективны против нового варианта, в течение двух недель. Разработка и вывод на рынок обновления вакцины (если таковое потребуется) займёт порядка 100 дней [7].
1. UNAIDS Data 2020, https://www.unaids.org/sites/default/files/media_asset/2020_aids-data-book_en.pdf
2. Martin Martinot et al, Remdesivir failure with SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA-polymerase mutation in a B-cell immunodeficient patient with protracted Covid-19, https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7543308/
3. Persistence and Evolution of SARS-CoV-2 in an Immunocompromised Host, https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMc2031364
4. Four cases of the new COVID-19 variant recorded in Botswana, https://www.mmegi.bw/news/four-cases-of-the-new-covid-19-variant-recorded-in-botswana/news
5. Israel 'on verge of emergency' as COVID Omicron variant found in country, https://www.jpost.com/breaking-news/south-african-variant-of-concern-discovered-in-israel-687074
6. Classification of Omicron (B.1.1.529): SARS-CoV-2 Variant of Concern, https://www.who.int/news/item/26-11-2021-classification-of-omicron-(b.1.1.529)-sars-cov-2-variant-of-concern
7. Pfizer/BioNTech, Moderna expect data on shot's protection against new COVID-19 variant soon, https://www.reuters.com/business/healthcare-pharmaceuticals/biontech-says-expect-more-data-new-variant-2-weeks-2021-11-26/
С самого начала пандемии несколько регионов вызывали у нас особые опасения. В их число, безусловно, входили и Индия, и Южная Африка.
Страны Южной Африки – одни из беднейших стран мира с крайне важной особенностью: высокой долей людей, живущих с ВИЧ – кое-где доля ВИЧ-положительных подростков и взрослых 15-49 лет составляет 18,2-27,6% в ЮАР, Ботсване, Лесото и Эсватини (бывш. Свазиленд) [1]. Несмотря на успехи в тестировании и обеспечении ВААРТ ВИЧ-положительных жителей этого региона (цель 90-90-90: минимум 90% ВИЧ-положительных знают свой статус, минимум 90% их них принимают терапию, минимум 90% их них имеют неопределяемую вирусную нагрузку), в абсолютных числах количество людей, не знающих свой статус, не принимающих терапию или не достигших неопределяемой вирусной нагрузки, и с весьма высокой вероятностью иммунокомпрометированных вследствие этого, велико.
Как нам известно из множества кейсов [2,3], у таких пациентов возможна персистенция SARS-CoV-2. В случае ВИЧ-инфекции ситуация отягощена тем, что выпадает целое звено иммунитета – T-хелперы – без которого невозможно формирование полноценного иммунного ответа. За время персистенции, измеряемое месяцами, вирус успевает в достаточной мере мутировать, чтобы успеть уйти от начавших появляться антител. Именно поэтому мы увидели такую дисперсию в мутациях: Индия, благодаря высокой плотности населения, дала менее уходящий от иммунного ответа, но весьма быстро распространяющийся вариант дельта, а ЮАР дала вариант бета – менее патогенный, но хорошо уходящий от иммунного ответа. Вариант дельта оказался настолько успешным, что вытеснил все остальные варианты из поля зрения.
Появление нового варианта, сочетающего оба этих свойства, было достаточно ожидаемым. Эволюционировав – вероятнее всего – в иммунокомпрометированных, он был обнаружен среди полностью привитых в Ботсване [4]. Как сообщается, из трёх заболевших в Израиле один был привит двумя дозами Vaxzevria, один – двумя дозами Janssen, а один – 3 дозами вакцины Comirnaty [5], что особенно настораживает.
Новому варианту была присвоена буква греческого алфавита ο (омикрон). ПЦР-тесты пока что его способны распознать, но по отдельным сообщениям лабораторий один из тестов неспособен обнаружить один из трёх целевых генов [6].
Разработчики вакцин ожидают данных о том, насколько имеющиеся вакцины эффективны против нового варианта, в течение двух недель. Разработка и вывод на рынок обновления вакцины (если таковое потребуется) займёт порядка 100 дней [7].
1. UNAIDS Data 2020, https://www.unaids.org/sites/default/files/media_asset/2020_aids-data-book_en.pdf
2. Martin Martinot et al, Remdesivir failure with SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA-polymerase mutation in a B-cell immunodeficient patient with protracted Covid-19, https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7543308/
3. Persistence and Evolution of SARS-CoV-2 in an Immunocompromised Host, https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMc2031364
4. Four cases of the new COVID-19 variant recorded in Botswana, https://www.mmegi.bw/news/four-cases-of-the-new-covid-19-variant-recorded-in-botswana/news
5. Israel 'on verge of emergency' as COVID Omicron variant found in country, https://www.jpost.com/breaking-news/south-african-variant-of-concern-discovered-in-israel-687074
6. Classification of Omicron (B.1.1.529): SARS-CoV-2 Variant of Concern, https://www.who.int/news/item/26-11-2021-classification-of-omicron-(b.1.1.529)-sars-cov-2-variant-of-concern
7. Pfizer/BioNTech, Moderna expect data on shot's protection against new COVID-19 variant soon, https://www.reuters.com/business/healthcare-pharmaceuticals/biontech-says-expect-more-data-new-variant-2-weeks-2021-11-26/
Омикрон, дети и АЗУИ
Чепурнов предположил возможность АЗУИ у переболевших [1] на основе моделирования рисков первичного/повторного заболевания [2]. Действительно, в этом исследовании говорится о снижении риска первичного заболевания для омикрона и об увеличении риска повторного, но это не значит, что риск повторного заболевания превышает риск первичного. В том же исследовании указано, что защита переболевших существует, но не упала ниже нуля.
Одним из признаков наличия АЗУИ было бы увеличение тяжести заболевания у иммунных, чего мы не наблюдаем. В действительности омикрон хорошо уклоняется от иммунного ответа, но при этом у вакцинированных защита от тяжёлого течения остаётся, судя по имеющимся данным. При этом разрабатывавшиеся вакцины для дельта-варианта, вполне вероятно, хуже защищали бы от заражения омикроном, чем вакцины на основе уханьского варианта. Фактически, омикрон эволюционировал достаточно далеко от основных вариантов, до этого распространённых в Южной Африке (как и во всём мире) [3] и научился обходить иммунный ответ.
Мы по-прежнему оцениваем вероятность АЗУИ как низкую. В реальности основная опасность омикрона, вероятно, будет исходить из событий суперспрединга [4]. Несмотря на заявления медицинских чиновников ЮАР, мы не склонны оценивать ситуацию как оптимистичную, учитывая крайне высокий базовый индекс репродукции омикрона (исходя из событий суперспрединга среди вакцинированных во время перелётов и на общественных мероприятиях).
Другую опасность представляет сдвиг в сторону заражения детей [5] и роста занятости педиатрических коек в ЮАР [6], в том числе в сторону группы 0-5 лет. Также непонятны возможные долгосрочные последствия заболевания – вполне вероятно, что мы узнаем о них не раньше, чем через полгода или позже.
Исходя из вышесказанного, в Восточной Европе, в том числе России, следует предположить ещё более пессимистичный сценарий развития событий, чем в ЮАР, учитывая низкую долю реально вакцинированных и наличие крайне сомнительных кандидатов в вакцины в гражданской вакцинации (таких, как Ковивак и Эпиваккорона).
Как и прежде, лучшей стратегией защиты является вакцинация, в том числе детей школьного возраста, в том числе после перенесённого заболевания COVID-19; ношение СИЗ; социальное дистанцирование.
Отсутствие вакцинации детей в России сыграет самую негативную роль в разворачивающемся процессе, так как вследствие вышеуказанного «стадный иммунитет», полученный вследствие переболевания дельтой, с большой степенью вероятности будет гораздо хуже работать против омикрона [2]. Немедленный ввод вакцин, прошедших III фазу КИ на взрослых и I/II фазы на детях, мог бы существенно снизить тяжкие последствия.
1. https://www.gazeta.ru/social/news/2021/12/04/n_16962877.shtml
2. Juliet R.C. Pulliam et al, Increased risk of SARS-CoV-2 reinfection associated with emergence of the Omicron variant in South Africa, https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2021.11.11.21266068v2
3. https://nextstrain.org/ncov/gisaid/africa
4. https://www.wsj.com/articles/omicron-cases-at-norway-christmas-party-provide-clues-on-new-variants-spread-11638554033
5. https://twitter.com/miamalan/status/1466680004809568256
6. https://www.reuters.com/world/africa/safrican-official-says-number-children-sick-with-covid-19-is-not-cause-panic-2021-12-04/
Чепурнов предположил возможность АЗУИ у переболевших [1] на основе моделирования рисков первичного/повторного заболевания [2]. Действительно, в этом исследовании говорится о снижении риска первичного заболевания для омикрона и об увеличении риска повторного, но это не значит, что риск повторного заболевания превышает риск первичного. В том же исследовании указано, что защита переболевших существует, но не упала ниже нуля.
Одним из признаков наличия АЗУИ было бы увеличение тяжести заболевания у иммунных, чего мы не наблюдаем. В действительности омикрон хорошо уклоняется от иммунного ответа, но при этом у вакцинированных защита от тяжёлого течения остаётся, судя по имеющимся данным. При этом разрабатывавшиеся вакцины для дельта-варианта, вполне вероятно, хуже защищали бы от заражения омикроном, чем вакцины на основе уханьского варианта. Фактически, омикрон эволюционировал достаточно далеко от основных вариантов, до этого распространённых в Южной Африке (как и во всём мире) [3] и научился обходить иммунный ответ.
Мы по-прежнему оцениваем вероятность АЗУИ как низкую. В реальности основная опасность омикрона, вероятно, будет исходить из событий суперспрединга [4]. Несмотря на заявления медицинских чиновников ЮАР, мы не склонны оценивать ситуацию как оптимистичную, учитывая крайне высокий базовый индекс репродукции омикрона (исходя из событий суперспрединга среди вакцинированных во время перелётов и на общественных мероприятиях).
Другую опасность представляет сдвиг в сторону заражения детей [5] и роста занятости педиатрических коек в ЮАР [6], в том числе в сторону группы 0-5 лет. Также непонятны возможные долгосрочные последствия заболевания – вполне вероятно, что мы узнаем о них не раньше, чем через полгода или позже.
Исходя из вышесказанного, в Восточной Европе, в том числе России, следует предположить ещё более пессимистичный сценарий развития событий, чем в ЮАР, учитывая низкую долю реально вакцинированных и наличие крайне сомнительных кандидатов в вакцины в гражданской вакцинации (таких, как Ковивак и Эпиваккорона).
Как и прежде, лучшей стратегией защиты является вакцинация, в том числе детей школьного возраста, в том числе после перенесённого заболевания COVID-19; ношение СИЗ; социальное дистанцирование.
Отсутствие вакцинации детей в России сыграет самую негативную роль в разворачивающемся процессе, так как вследствие вышеуказанного «стадный иммунитет», полученный вследствие переболевания дельтой, с большой степенью вероятности будет гораздо хуже работать против омикрона [2]. Немедленный ввод вакцин, прошедших III фазу КИ на взрослых и I/II фазы на детях, мог бы существенно снизить тяжкие последствия.
1. https://www.gazeta.ru/social/news/2021/12/04/n_16962877.shtml
2. Juliet R.C. Pulliam et al, Increased risk of SARS-CoV-2 reinfection associated with emergence of the Omicron variant in South Africa, https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2021.11.11.21266068v2
3. https://nextstrain.org/ncov/gisaid/africa
4. https://www.wsj.com/articles/omicron-cases-at-norway-christmas-party-provide-clues-on-new-variants-spread-11638554033
5. https://twitter.com/miamalan/status/1466680004809568256
6. https://www.reuters.com/world/africa/safrican-official-says-number-children-sick-with-covid-19-is-not-cause-panic-2021-12-04/
Омикрон-вариант SARS-CoV-2 и Спутник V
Центр Гамалеи опубликовал данные о падении нейтрализации в 11,8 раза с омикрон-вариантом коронавируса SARS-CoV-2 для вакцины Спутник V.
Незадолго до этого центр Гамалеи выпустил пресс-релиз [2], где обвинил авторов исследования «Broadly neutralizing antibodies overcome SARS-CoV-2 Omicron antigenic shift» [3] в намеренном («deliberately») использовании нерепрезентативных сывороток (нам не удалось обнаружить признаков намеренного искажения данных – какие сыворотки были, такие и взяли).
При этом опубликованные данные о нейтрализации ЦПД (цитопатического действия) вируса сывороткой плазмы иммунизированных Спутником V как раз содержат пример манипуляции данными: на представленной иллюстрации [4] титр нейтрализации для каждой вакцины выровнен по отметке 100%, хотя очевидно, что он будет разным для каждой вакцины (здесь можно было бы использовать violin plot вместо bar chart для того, чтобы отобразить реальные данные).
Представленные на другой иллюстрации [5] данные (можно взять за условную отсечку нейтрализацию 1:16) говорят о том, что по нейтрализации и длительности иммунитета Спутник V можно считать, вероятно, находящимся в одной категории с мРНК-вакцинами.
Гипотеза о том, что неиспользование пролинов вызывает меньшее падение в нейтрализации, вызывает всё большие сомнения, поскольку в исследовании [3] мы не видим подобной картины у вакцины AstraZeneca Vaxzevria/Covishield, которая содержит код «дикого» варианта S-белка.
Подобные пресс-релизы вызывают крайнюю озабоченность и не вызывают доверия, в особенности по сравнению с пресс-релизами компании Moderna, честно признавшими необходимость создания специфического для омикрон-варианта буста [6].
1. https://twitter.com/i/broadcasts/1lDGLLEnAEZGm
2. https://sputnikvaccine.com/newsroom/pressreleases/the-gamaleya-center-statement-omicron/
3. Elisabetta Cameroni et al, Broadly neutralizing antibodies overcome SARS-CoV-2 Omicron antigenic shift, https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.12.12.472269v1.full
4. https://twitter.com/sputnikvaccine/status/1471857926155419648/photo/1
5. https://twitter.com/sputnikvaccine/status/1471812455517011973/photo/1
6. Moderna announces strategy to address Omicron (B.1.1.529) SARS-COV-2 Variant, https://investors.modernatx.com/news/news-details/2021/Moderna-Announces-Strategy-to-Address-Omicron-B.1.1.529-SARS-CoV-2-Variant/default.aspx
Центр Гамалеи опубликовал данные о падении нейтрализации в 11,8 раза с омикрон-вариантом коронавируса SARS-CoV-2 для вакцины Спутник V.
Незадолго до этого центр Гамалеи выпустил пресс-релиз [2], где обвинил авторов исследования «Broadly neutralizing antibodies overcome SARS-CoV-2 Omicron antigenic shift» [3] в намеренном («deliberately») использовании нерепрезентативных сывороток (нам не удалось обнаружить признаков намеренного искажения данных – какие сыворотки были, такие и взяли).
При этом опубликованные данные о нейтрализации ЦПД (цитопатического действия) вируса сывороткой плазмы иммунизированных Спутником V как раз содержат пример манипуляции данными: на представленной иллюстрации [4] титр нейтрализации для каждой вакцины выровнен по отметке 100%, хотя очевидно, что он будет разным для каждой вакцины (здесь можно было бы использовать violin plot вместо bar chart для того, чтобы отобразить реальные данные).
Представленные на другой иллюстрации [5] данные (можно взять за условную отсечку нейтрализацию 1:16) говорят о том, что по нейтрализации и длительности иммунитета Спутник V можно считать, вероятно, находящимся в одной категории с мРНК-вакцинами.
Гипотеза о том, что неиспользование пролинов вызывает меньшее падение в нейтрализации, вызывает всё большие сомнения, поскольку в исследовании [3] мы не видим подобной картины у вакцины AstraZeneca Vaxzevria/Covishield, которая содержит код «дикого» варианта S-белка.
Подобные пресс-релизы вызывают крайнюю озабоченность и не вызывают доверия, в особенности по сравнению с пресс-релизами компании Moderna, честно признавшими необходимость создания специфического для омикрон-варианта буста [6].
1. https://twitter.com/i/broadcasts/1lDGLLEnAEZGm
2. https://sputnikvaccine.com/newsroom/pressreleases/the-gamaleya-center-statement-omicron/
3. Elisabetta Cameroni et al, Broadly neutralizing antibodies overcome SARS-CoV-2 Omicron antigenic shift, https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.12.12.472269v1.full
4. https://twitter.com/sputnikvaccine/status/1471857926155419648/photo/1
5. https://twitter.com/sputnikvaccine/status/1471812455517011973/photo/1
6. Moderna announces strategy to address Omicron (B.1.1.529) SARS-COV-2 Variant, https://investors.modernatx.com/news/news-details/2021/Moderna-Announces-Strategy-to-Address-Omicron-B.1.1.529-SARS-CoV-2-Variant/default.aspx